PEFC的成立可以追溯到1999年，是一个独立的，非赢利的，非政府组织，当时为了应对欧洲小林场主及家庭林场主的一些特殊要求，来自11个国家的相关组织聚集在一起成立了PEFC，通过第三方独立认证促进可持续性的森林管理。自成立以来，PEFC一直快速发展，相继在欧洲、美洲、大洋洲、非洲和亚洲开展了业务。在今年的8月份，印度也正式加入了PEFC认证，成为了该认证的第40名成员。

PEFC发展的一个里程碑事件是在2005年，加拿大森林认证体系获得PEFC认可，PEFC成为世界上最大的森林认证体系，认证面积超过1亿公顷，2007年达到了2亿公顷。

2009年是PEFC另一个重要之年，加蓬成为认可的第一个非洲森林认证体系国家，第一个热带森林认证体系。几个月后，马来西亚成为第二个PEFC认证的热带国家，是加入该体系的亚洲第一个国家。

2009年后PEFC开始更加忙碌，从2013年马来西亚吉隆坡第一个PEFC森林认证周，到2014年阿根廷、中国和印度尼西亚国家森林认证体系获得PEFC认可，活动频繁。

当今世界，木材的滥砍乱伐现象仍然非常严重，第三方非盈利森林认证组织的成立有助于推动世界林业资源和环境的持续发展，保护世界生态的多样性，也有利于林业资源的健康稳定发展。